Theo quy định của Quyết định này thì có 04 mức phụ cấp là 25, 20, 15 và 10%.
Mức phụ cấp áp dụng đối với Giám thị, Chính trị viên, Phó Giám thị trại giam, trại tạm giam; trợ lý giam giữ, Trợ lý giáo dục, Đội trưởng, Đội phó, Tổ trưởng, Quản giáo, Vệ binh, Cảnh vệ tư pháp, Bác sĩ, nhân viên quân y khám chữa bệnh cho phạm nhân và bị can ở các trại giam, trại tạm giam là 25%.
Mức phụ cấp đối với cán bộ, chiến sĩ trực tiếp làm các công việc còn lại ở các trại giam, trại tạm giam là 20%.
Mức phụ cấp áp dụng đối với cán bộ thuộc Cơ quan quản lý thi hành án hình sự Bộ Quốc phòng và Cơ quan Thi hành án hình sự cấp Quân khu làm công tác lãnh đạo, chỉ huy, tham mưu, kiểm tra công tác trại giam, trại tạm giam, nhà tạm giữ là 15%.
Mức phụ cấp áp dụng đối với cán bộ, chiến sĩ làm các công việc ở các nhà tạm giữ, nhà tạm giữ có buồng tạm giam là 10%.
Cách tính hưởng phụ cấp là tính trên mức lương cấp bậc quân hàm, ngạch bậc hiện hưởng hoặc phụ cấp quân hàm cộng phụ cấp chức vụ lãnh đạo và phụ cấp thâm niên vượt khung (nếu có). Thời gian không được tính hưởng phụ cấp đặc thù bao gồm: (1) Thời gian đi công tác, làm việc học tập ở nước ngoài được hưởng tiền lương theo Nghị định số 204; (2) Thời gian nghỉ việc không hưởng lương liên tục từ 1 tháng trở lên; (3) Thời gian nghỉ việc hưởng bảo hiểm xã hội theo quy định của pháp luật về bảo hiểm xã hội; (4) Thời gian bị đình chỉ công tác hoặc bị tạm giữ, tạm giam.
Quyết định này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 15/3/2013.