Nghị định gồm 6 chương, 17 điều quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số quy định của Nghị quyết số 49 về áp dụng tiêu chí về vốn đầu tư và về dự án, công trình đang trong quá trình triển khai thực hiện, phát sinh vấn đề thuộc tiêu chí dự án, công trình quan trọng quốc gia; về tổ chức và phương thức hoạt động của Hội đồng thẩm định nhà nước và cơ quan được giao nhiệm vụ thẩm định, thuê tư vấn thẩm tra và tính chi phí thẩm định, thẩm tra dự án, công trình quan trọng quốc gia, hồ sơ, thủ tục trình thẩm định dự án, công trình quan trọng quốc gia.
Theo quy định của Nghị định này thì vốn đầu tư quy định tại khoản 1 Điều 3 và khoản 1 Điều 4 Nghị quyết số 49 được tính theo thời giá tháng 6/2010. Các dự án, công trình khi xem xét đáp ứng tiêu chí về dự án, công trình quan trọng quốc gia phải quy đổi vốn đầu tư về thời điểm này theo Hệ số trượt giá. Hệ số trượt giá được xác định theo chỉ số giá tiêu dùng do Tổng Cục thống kê ban hành.
Nghị định quy định rõ, dự án, công trình đang triển khai thực hiện bao gồm dự án, công trình đã có quyết định đầu tư hoặc đã được cấp Giấy chứng nhận đầu tư. Dự án đang trong quá trình triển khai thực hiện, phát sinh vấn đề thuộc tiêu chí dự án, công trình quan trọng quốc gia là sau khi Nghị quyết số 49 có hiệu lực, các dự án, công trình này có sự thay đổi tăng lên của các nội dung thuộc dự án, công trình so với quyết định đầu tư, Giấy chứng nhận đầu tư đã cấp hoặc các quyết định điều chỉnh trước đó, mà các nội dung thay đổi này thuộc tiêu chí về dự án, công trình quan trọng quốc gia theo quy định tại Nghị quyết số 49. Nghị định quy định rõ, các dự án, công trình phát sinh vấn đề này sẽ được tiếp tục triển khai thực hiện và chủ đầu tư phải báo cáo các vấn đề phát sinh lên chủ thể có thẩm quyền quyết định đầu tư hoặc Bộ quản lý chuyên ngành và cơ quan cấp Giấy chứng nhận đầu tư để xem xét việc điều chỉnh dự án. Người có thẩm quyền quyết định đầu tư hoặc Bộ quản lý chuyên ngành và cơ quan cấp Giấy chứng nhận đầu tư có trách nhiệm báo cáo Thủ tướng Chính phủ để Thủ tướng xem xét cho phép về chủ trương trước khi điều chỉnh và chỉ đạo báo cáo Quốc hội tại kỳ họp cuối năm về tình hình triển khai thực hiện dự án, trong đó có vấn đề phát sinh tiêu chí thuộc dự án, công trình quan trọng quốc gia.
Cũng theo quy định tại Nghị định này thì Hội đồng thẩm định nhà nước do Thủ tướng Chính phủ quyết định thành lập theo từng dự án, công trình có nhiệm vụ tổ chức thẩm định các dự án, công trình quan trọng quốc gia để báo cáo Thủ tướng Chính phủ quyết định đầu tư hoặc trình Quốc hội quyết định chủ trương đầu tư. Chủ tịch Hội đồng do Bộ trưởng Bộ Kế hoạch và Đầu tư hoặc Lãnh đạo cơ quan khác do Thủ tướng Chính phủ quyết định. Chủ tịch và thành viên Hội đồng chịu trách nhiệm trực tiếp trước Thủ tướng Chính phủ. Hội đồng làm việc theo chế độ tập thể, Phiên họp được coi là hợp lệ khi có ít nhất 50% số thành viên tham dự (kể cả người được ủy quyền). Ý kiến kết luận được thống nhất theo nguyên tắc đa số; riêng các kết luận cuối cùng thông qua các nội dung thẩm định dự án, công trình quan trọng quốc gia trình Thủ tướng Chính phủ phải được ít nhất 2/3 số thành viên Hội đồng thông qua.
Chủ tịch Hội đồng thẩm định nhà nước hoặc Thủ trưởng cơ quan được giao nhiệm vụ thẩm định quyết định việc thuê tổ chức hoặc cá nhân trong nước, nước ngoài hoặc liên danh trong nước và nước ngoài thực hiện giao nhiệm vụ thẩm định thuê để thực hiện một hoặc một số phần công việc của nội dung thẩm định dự án, công trình quan trong quốc gia.
Chi phí thẩm tra và thẩm định các dự án, công trình quan trọng quốc gia được tính như sau:
- Định mức chi phí thẩm tra Báo cáo nghiên cứu tiền khả thi được tính bằng định mức chi phí thẩm tra Báo cáo nghiên cứu khả thi.
- Trường hợp thành lập Hội đồng thẩm định nhà nước, chi phí thẩm định được tính bằng 20% định mức chi phí thẩm tra; trường hợp không thành lập Hội đồng thì chi phí thẩm định được tính bằng 15% định mức chi phí thẩm tra.
Nghị định này có hiệu lực kể từ ngày 20/02/2013.